Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR4P61073 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR4P61073 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR4P61073 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR4P61073 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR4P61073 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR4P61073 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR4P61073 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR4P61073 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR4P61073 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR4P61073 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR4P61073 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR4P61073 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR4P61073 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR4P61073 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR4P61073 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR4P61073 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR4P61073 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR4P61073 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR4P61073 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR4P61073 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CXCR4P61073 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR4P61073 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR4P61073 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR4P61073 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR4P61073 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR4P61073 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCR4P61073 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXCR4P61073 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCR4P61073 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCR4P61073 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCR4P61073 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR4P61073 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR4P61073 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR4P61073 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCR4P61073 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCR4P61073 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR4P61073 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR4P61073 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR4P61073 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR4P61073 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR4P61073 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR4P61073 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR4P61073 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCR4P61073 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCR4P61073 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms