Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB8AP61006 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB8AP61006 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB8AP61006 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB8AP61006 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB8AP61006 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB8AP61006 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB8AP61006 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB8AP61006 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB8AP61006 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB8AP61006 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB8AP61006 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB8AP61006 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB8AP61006 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB8AP61006 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB8AP61006 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB8AP61006 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB8AP61006 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB8AP61006 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB8AP61006 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB8AP61006 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB8AP61006 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB8AP61006 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB8AP61006 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB8AP61006 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB8AP61006 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB8AP61006 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB8AP61006 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB8AP61006 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB8AP61006 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB8AP61006 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB8AP61006 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB8AP61006 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB8AP61006 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB8AP61006 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB8AP61006 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB8AP61006 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB8AP61006 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms