Protein–RNA interactions for Protein: P60059

SEC61G, Protein transport protein Sec61 subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC61GP60059 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC61GP60059 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC61GP60059 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC61GP60059 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC61GP60059 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC61GP60059 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEC61GP60059 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC61GP60059 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEC61GP60059 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms