Protein–RNA interactions for Protein: P59826

BPIFB3, BPI fold-containing family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB3P59826 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFB3P59826 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFB3P59826 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BPIFB3P59826 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFB3P59826 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BPIFB3P59826 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BPIFB3P59826 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BPIFB3P59826 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms