Protein–RNA interactions for Protein: P57076

C21orf59, UPF0769 protein C21orf59, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf59P57076 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C21orf59P57076 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C21orf59P57076 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
C21orf59P57076 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C21orf59P57076 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C21orf59P57076 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
C21orf59P57076 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C21orf59P57076 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C21orf59P57076 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C21orf59P57076 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C21orf59P57076 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C21orf59P57076 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C21orf59P57076 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
C21orf59P57076 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C21orf59P57076 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C21orf59P57076 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C21orf59P57076 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C21orf59P57076 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C21orf59P57076 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
C21orf59P57076 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C21orf59P57076 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C21orf59P57076 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C21orf59P57076 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C21orf59P57076 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C21orf59P57076 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C21orf59P57076 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C21orf59P57076 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C21orf59P57076 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C21orf59P57076 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
C21orf59P57076 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
C21orf59P57076 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C21orf59P57076 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C21orf59P57076 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C21orf59P57076 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C21orf59P57076 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C21orf59P57076 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C21orf59P57076 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C21orf59P57076 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C21orf59P57076 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
C21orf59P57076 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C21orf59P57076 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C21orf59P57076 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C21orf59P57076 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C21orf59P57076 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C21orf59P57076 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C21orf59P57076 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
C21orf59P57076 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C21orf59P57076 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C21orf59P57076 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C21orf59P57076 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C21orf59P57076 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C21orf59P57076 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C21orf59P57076 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C21orf59P57076 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C21orf59P57076 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms