Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN12P56749 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN12P56749 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN12P56749 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN12P56749 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN12P56749 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN12P56749 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLDN12P56749 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN12P56749 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN12P56749 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN12P56749 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN12P56749 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLDN12P56749 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN12P56749 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN12P56749 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN12P56749 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN12P56749 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN12P56749 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN12P56749 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN12P56749 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN12P56749 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN12P56749 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN12P56749 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN12P56749 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms