Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTBP2P56545 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTBP2P56545 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTBP2P56545 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTBP2P56545 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTBP2P56545 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTBP2P56545 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTBP2P56545 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTBP2P56545 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTBP2P56545 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTBP2P56545 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTBP2P56545 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTBP2P56545 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTBP2P56545 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTBP2P56545 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTBP2P56545 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTBP2P56545 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTBP2P56545 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTBP2P56545 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTBP2P56545 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTBP2P56545 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTBP2P56545 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTBP2P56545 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTBP2P56545 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTBP2P56545 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTBP2P56545 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTBP2P56545 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTBP2P56545 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTBP2P56545 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTBP2P56545 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTBP2P56545 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTBP2P56545 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTBP2P56545 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTBP2P56545 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTBP2P56545 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTBP2P56545 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTBP2P56545 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTBP2P56545 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTBP2P56545 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTBP2P56545 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms