Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASP9P55211 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP9P55211 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP9P55211 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP9P55211 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP9P55211 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP9P55211 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP9P55211 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP9P55211 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP9P55211 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CASP9P55211 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP9P55211 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP9P55211 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP9P55211 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP9P55211 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP9P55211 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP9P55211 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASP9P55211 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP9P55211 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP9P55211 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP9P55211 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP9P55211 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP9P55211 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP9P55211 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP9P55211 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP9P55211 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP9P55211 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP9P55211 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP9P55211 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP9P55211 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP9P55211 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP9P55211 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP9P55211 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP9P55211 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP9P55211 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP9P55211 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP9P55211 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP9P55211 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP9P55211 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP9P55211 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP9P55211 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP9P55211 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP9P55211 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP9P55211 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP9P55211 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP9P55211 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP9P55211 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP9P55211 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP9P55211 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP9P55211 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP9P55211 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP9P55211 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP9P55211 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP9P55211 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP9P55211 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP9P55211 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP9P55211 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP9P55211 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP9P55211 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP9P55211 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP9P55211 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP9P55211 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP9P55211 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP9P55211 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP9P55211 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP9P55211 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP9P55211 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP9P55211 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASP9P55211 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASP9P55211 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP9P55211 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP9P55211 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP9P55211 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP9P55211 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP9P55211 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP9P55211 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP9P55211 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP9P55211 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP9P55211 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP9P55211 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP9P55211 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP9P55211 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP9P55211 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP9P55211 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP9P55211 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP9P55211 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP9P55211 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP9P55211 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP9P55211 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP9P55211 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP9P55211 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP9P55211 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP9P55211 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP9P55211 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP9P55211 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP9P55211 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP9P55211 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP9P55211 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP9P55211 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP9P55211 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms