Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSE1LP55060 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSE1LP55060 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSE1LP55060 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSE1LP55060 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSE1LP55060 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSE1LP55060 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSE1LP55060 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSE1LP55060 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSE1LP55060 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSE1LP55060 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSE1LP55060 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSE1LP55060 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSE1LP55060 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSE1LP55060 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSE1LP55060 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSE1LP55060 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSE1LP55060 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSE1LP55060 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSE1LP55060 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSE1LP55060 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSE1LP55060 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSE1LP55060 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSE1LP55060 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSE1LP55060 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSE1LP55060 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSE1LP55060 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CSE1LP55060 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CSE1LP55060 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSE1LP55060 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSE1LP55060 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSE1LP55060 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSE1LP55060 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSE1LP55060 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSE1LP55060 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CSE1LP55060 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSE1LP55060 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSE1LP55060 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSE1LP55060 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSE1LP55060 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSE1LP55060 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSE1LP55060 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSE1LP55060 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSE1LP55060 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSE1LP55060 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSE1LP55060 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSE1LP55060 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSE1LP55060 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSE1LP55060 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSE1LP55060 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CSE1LP55060 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CSE1LP55060 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.4 ms