Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NAPAP54920 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NAPAP54920 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NAPAP54920 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NAPAP54920 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NAPAP54920 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NAPAP54920 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NAPAP54920 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NAPAP54920 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NAPAP54920 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NAPAP54920 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NAPAP54920 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NAPAP54920 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NAPAP54920 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NAPAP54920 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NAPAP54920 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NAPAP54920 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NAPAP54920 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NAPAP54920 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NAPAP54920 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NAPAP54920 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NAPAP54920 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NAPAP54920 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NAPAP54920 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NAPAP54920 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NAPAP54920 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NAPAP54920 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NAPAP54920 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NAPAP54920 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NAPAP54920 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NAPAP54920 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NAPAP54920 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NAPAP54920 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NAPAP54920 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NAPAP54920 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NAPAP54920 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NAPAP54920 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NAPAP54920 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NAPAP54920 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NAPAP54920 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NAPAP54920 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NAPAP54920 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NAPAP54920 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NAPAP54920 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NAPAP54920 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NAPAP54920 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NAPAP54920 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NAPAP54920 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NAPAP54920 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NAPAP54920 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NAPAP54920 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NAPAP54920 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NAPAP54920 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NAPAP54920 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NAPAP54920 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NAPAP54920 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NAPAP54920 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NAPAP54920 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NAPAP54920 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NAPAP54920 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NAPAP54920 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NAPAP54920 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NAPAP54920 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NAPAP54920 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NAPAP54920 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NAPAP54920 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NAPAP54920 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NAPAP54920 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NAPAP54920 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NAPAP54920 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NAPAP54920 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NAPAP54920 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NAPAP54920 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NAPAP54920 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NAPAP54920 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NAPAP54920 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NAPAP54920 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NAPAP54920 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NAPAP54920 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NAPAP54920 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NAPAP54920 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NAPAP54920 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NAPAP54920 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NAPAP54920 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NAPAP54920 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NAPAP54920 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NAPAP54920 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NAPAP54920 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NAPAP54920 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NAPAP54920 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NAPAP54920 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NAPAP54920 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NAPAP54920 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NAPAP54920 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NAPAP54920 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NAPAP54920 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NAPAP54920 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NAPAP54920 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NAPAP54920 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
NAPAP54920 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms