Protein–RNA interactions for Protein: P53131

PRP43, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP43, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP43P53131 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt13.03□□□□□ -0.32
PRP43P53131 POM34YLR018C 900 nt13.01□□□□□ -0.33
PRP43P53131 HIP1YGR191W 1812 nt13□□□□□ -0.33
PRP43P53131 PRO1YDR300C 1287 nt13□□□□□ -0.33
PRP43P53131 TSC10YBR265W 963 nt13□□□□□ -0.33
PRP43P53131 STR3YGL184C 1398 nt12.99□□□□□ -0.33
PRP43P53131 YNR029CYNR029C 1290 nt12.99□□□□□ -0.33
PRP43P53131 Q0182Q0182 405 nt12.98□□□□□ -0.33
PRP43P53131 RPM1RPM1 483 nt12.98□□□□□ -0.33
PRP43P53131 STE4YOR212W 1272 nt12.97□□□□□ -0.33
PRP43P53131 ATG15YCR068W 1563 nt12.94□□□□□ -0.34
PRP43P53131 RIB3YDR487C 627 nt12.94□□□□□ -0.34
PRP43P53131 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.92□□□□□ -0.34
PRP43P53131 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.92□□□□□ -0.34
PRP43P53131 YLR279WYLR279W 390 nt12.92□□□□□ -0.34
PRP43P53131 ADH7YCR105W 1086 nt12.89□□□□□ -0.35
PRP43P53131 MET28YIR017C 564 nt12.89□□□□□ -0.35
PRP43P53131 PAU15YIR041W 375 nt12.89□□□□□ -0.35
PRP43P53131 YML089CYML089C 369 nt12.89□□□□□ -0.35
PRP43P53131 TIF6YPR016C 738 nt12.89□□□□□ -0.35
PRP43P53131 YJL195CYJL195C 702 nt12.87□□□□□ -0.35
PRP43P53131 YLR349WYLR349W 507 nt12.87□□□□□ -0.35
PRP43P53131 MSB4YOL112W 1479 nt12.85□□□□□ -0.35
PRP43P53131 FUN14YAL008W 597 nt12.85□□□□□ -0.35
PRP43P53131 YCL074WYCL074W 927 nt12.84□□□□□ -0.35
PRP43P53131 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.84□□□□□ -0.35
PRP43P53131 LSC2YGR244C 1284 nt12.83□□□□□ -0.36
PRP43P53131 GPN2YOR262W 1044 nt12.83□□□□□ -0.36
PRP43P53131 ADH1YOL086C 1047 nt12.78□□□□□ -0.36
PRP43P53131 GAP1YKR039W 1809 nt12.74□□□□□ -0.37
PRP43P53131 AAC1YMR056C 930 nt12.74□□□□□ -0.37
PRP43P53131 LOT5YKL183W 921 nt12.73□□□□□ -0.37
PRP43P53131 FIT3YOR383C 615 nt12.71□□□□□ -0.37
PRP43P53131 ARP6YLR085C 1317 nt12.69□□□□□ -0.38
PRP43P53131 YPI1YFR003C 468 nt12.69□□□□□ -0.38
PRP43P53131 APT2YDR441C 546 nt12.68□□□□□ -0.38
PRP43P53131 PLB1YMR008C 1995 nt12.66□□□□□ -0.38
PRP43P53131 GND1YHR183W 1470 nt12.65□□□□□ -0.38
PRP43P53131 ZTA1YBR046C 1005 nt12.64□□□□□ -0.39
PRP43P53131 YEL008WYEL008W 381 nt12.61□□□□□ -0.39
PRP43P53131 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.61□□□□□ -0.39
PRP43P53131 FUR4YBR021W 1902 nt12.6□□□□□ -0.39
PRP43P53131 CPD1YGR247W 720 nt12.6□□□□□ -0.39
PRP43P53131 AKR2YOR034C 2250 nt12.6□□□□□ -0.39
PRP43P53131 SMM1YNR015W 1155 nt12.59□□□□□ -0.39
PRP43P53131 RTN2YDL204W 1182 nt12.58□□□□□ -0.4
PRP43P53131 ALP1YNL270C 1722 nt12.54□□□□□ -0.4
PRP43P53131 NVJ2YPR091C 2313 nt12.54□□□□□ -0.4
PRP43P53131 YAR028WYAR028W 705 nt12.54□□□□□ -0.4
PRP43P53131 DIF1YLR437C 402 nt12.54□□□□□ -0.4
PRP43P53131 RIB2YOL066C 1776 nt12.53□□□□□ -0.4
PRP43P53131 MTG2YHR168W 1557 nt12.52□□□□□ -0.41
PRP43P53131 UTR1YJR049C 1593 nt12.51□□□□□ -0.41
PRP43P53131 ESS1YJR017C 513 nt12.5□□□□□ -0.41
PRP43P53131 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.49□□□□□ -0.41
PRP43P53131 YGR259CYGR259C 441 nt12.43□□□□□ -0.42
PRP43P53131 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.42□□□□□ -0.42
PRP43P53131 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.42□□□□□ -0.42
PRP43P53131 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.42□□□□□ -0.42
PRP43P53131 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.42□□□□□ -0.42
PRP43P53131 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.42□□□□□ -0.42
PRP43P53131 YKR005CYKR005C 1578 nt12.39□□□□□ -0.43
PRP43P53131 VRG4YGL225W 1014 nt12.39□□□□□ -0.43
PRP43P53131 FCY21YER060W 1587 nt12.39□□□□□ -0.43
PRP43P53131 PRY1YJL079C 900 nt12.38□□□□□ -0.43
PRP43P53131 PAC11YDR488C 1602 nt12.37□□□□□ -0.43
PRP43P53131 UGA4YDL210W 1716 nt12.37□□□□□ -0.43
PRP43P53131 YJL055WYJL055W 738 nt12.37□□□□□ -0.43
PRP43P53131 SEN2YLR105C 1134 nt12.36□□□□□ -0.43
PRP43P53131 PAU5YFL020C 369 nt12.33□□□□□ -0.44
PRP43P53131 PRM5YIL117C 957 nt12.32□□□□□ -0.44
PRP43P53131 SED1YDR077W 1017 nt12.29□□□□□ -0.44
PRP43P53131 ALD4YOR374W 1560 nt12.29□□□□□ -0.44
PRP43P53131 SAM35YHR083W 990 nt12.28□□□□□ -0.44
PRP43P53131 HXT12YIL170W 1374 nt12.26□□□□□ -0.45
PRP43P53131 PRP4YPR178W 1398 nt12.26□□□□□ -0.45
PRP43P53131 LIP1YMR298W 453 nt12.25□□□□□ -0.45
PRP43P53131 PUP1YOR157C 786 nt12.23□□□□□ -0.45
PRP43P53131 PGC1YPL206C 966 nt12.23□□□□□ -0.45
PRP43P53131 NAP1YKR048C 1254 nt12.22□□□□□ -0.45
PRP43P53131 MEP3YPR138C 1470 nt12.21□□□□□ -0.46
PRP43P53131 YMR103CYMR103C 363 nt12.2□□□□□ -0.46
PRP43P53131 BMT6YLR063W 1098 nt12.19□□□□□ -0.46
PRP43P53131 YPL251WYPL251W 303 nt12.18□□□□□ -0.46
PRP43P53131 HSP60YLR259C 1719 nt12.17□□□□□ -0.46
PRP43P53131 TOA2YKL058W 369 nt12.16□□□□□ -0.46
PRP43P53131 DPS1YLL018C 1674 nt12.16□□□□□ -0.46
PRP43P53131 BRR1YPR057W 1026 nt12.15□□□□□ -0.46
PRP43P53131 YJL064WYJL064W 396 nt12.13□□□□□ -0.47
PRP43P53131 CCT5YJR064W 1689 nt12.13□□□□□ -0.47
PRP43P53131 CSM1YCR086W 573 nt12.12□□□□□ -0.47
PRP43P53131 YBR232CYBR232C 360 nt12.12□□□□□ -0.47
PRP43P53131 STP3YLR375W 1032 nt12.11□□□□□ -0.47
PRP43P53131 LSB5YCL034W 1065 nt12.11□□□□□ -0.47
PRP43P53131 HXT1YHR094C 1713 nt12.11□□□□□ -0.47
PRP43P53131 THI72YOR192C 1800 nt12.1□□□□□ -0.47
PRP43P53131 YBL086CYBL086C 1401 nt12.1□□□□□ -0.47
PRP43P53131 GND2YGR256W 1479 nt12.08□□□□□ -0.48
PRP43P53131 YJL118WYJL118W 660 nt12.05□□□□□ -0.48
PRP43P53131 TAF13YML098W 504 nt12.05□□□□□ -0.48
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