Protein–RNA interactions for Protein: P52799

EFNB2, Ephrin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB2P52799 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFNB2P52799 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNB2P52799 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNB2P52799 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNB2P52799 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNB2P52799 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNB2P52799 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNB2P52799 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNB2P52799 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNB2P52799 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNB2P52799 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFNB2P52799 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNB2P52799 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNB2P52799 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNB2P52799 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNB2P52799 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNB2P52799 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNB2P52799 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNB2P52799 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNB2P52799 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNB2P52799 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNB2P52799 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNB2P52799 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNB2P52799 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNB2P52799 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNB2P52799 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms