Protein–RNA interactions for Protein: P52594

AGFG1, Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGFG1P52594 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGFG1P52594 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGFG1P52594 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AGFG1P52594 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AGFG1P52594 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGFG1P52594 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGFG1P52594 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGFG1P52594 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGFG1P52594 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGFG1P52594 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGFG1P52594 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGFG1P52594 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AGFG1P52594 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGFG1P52594 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGFG1P52594 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGFG1P52594 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AGFG1P52594 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AGFG1P52594 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGFG1P52594 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGFG1P52594 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGFG1P52594 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGFG1P52594 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGFG1P52594 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGFG1P52594 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGFG1P52594 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGFG1P52594 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGFG1P52594 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGFG1P52594 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGFG1P52594 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AGFG1P52594 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGFG1P52594 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AGFG1P52594 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGFG1P52594 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGFG1P52594 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms