Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2JP52435 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2JP52435 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2JP52435 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2JP52435 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2JP52435 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2JP52435 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2JP52435 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2JP52435 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2JP52435 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2JP52435 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2JP52435 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2JP52435 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2JP52435 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2JP52435 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2JP52435 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2JP52435 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2JP52435 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2JP52435 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2JP52435 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2JP52435 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2JP52435 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2JP52435 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2JP52435 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2JP52435 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2JP52435 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2JP52435 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2JP52435 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2JP52435 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2JP52435 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2JP52435 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2JP52435 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2JP52435 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2JP52435 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2JP52435 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2JP52435 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2JP52435 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2JP52435 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR2JP52435 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR2JP52435 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR2JP52435 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2JP52435 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR2JP52435 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR2JP52435 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2JP52435 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2JP52435 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2JP52435 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms