Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RND2P52198 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RND2P52198 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RND2P52198 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RND2P52198 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RND2P52198 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RND2P52198 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RND2P52198 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RND2P52198 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RND2P52198 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RND2P52198 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RND2P52198 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RND2P52198 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RND2P52198 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RND2P52198 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RND2P52198 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RND2P52198 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RND2P52198 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RND2P52198 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RND2P52198 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RND2P52198 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RND2P52198 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RND2P52198 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RND2P52198 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RND2P52198 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RND2P52198 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RND2P52198 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RND2P52198 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RND2P52198 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RND2P52198 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RND2P52198 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RND2P52198 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RND2P52198 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RND2P52198 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RND2P52198 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RND2P52198 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RND2P52198 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RND2P52198 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RND2P52198 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RND2P52198 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RND2P52198 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RND2P52198 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RND2P52198 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RND2P52198 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RND2P52198 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RND2P52198 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RND2P52198 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RND2P52198 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RND2P52198 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RND2P52198 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RND2P52198 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RND2P52198 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RND2P52198 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RND2P52198 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RND2P52198 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RND2P52198 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RND2P52198 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RND2P52198 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RND2P52198 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RND2P52198 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RND2P52198 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RND2P52198 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RND2P52198 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RND2P52198 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RND2P52198 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RND2P52198 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RND2P52198 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RND2P52198 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RND2P52198 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RND2P52198 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RND2P52198 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RND2P52198 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RND2P52198 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RND2P52198 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RND2P52198 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RND2P52198 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RND2P52198 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RND2P52198 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RND2P52198 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RND2P52198 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RND2P52198 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RND2P52198 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RND2P52198 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RND2P52198 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RND2P52198 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RND2P52198 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RND2P52198 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RND2P52198 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RND2P52198 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RND2P52198 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RND2P52198 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RND2P52198 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RND2P52198 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RND2P52198 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RND2P52198 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RND2P52198 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RND2P52198 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RND2P52198 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RND2P52198 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RND2P52198 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms