Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEK2P51955 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NEK2P51955 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEK2P51955 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NEK2P51955 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NEK2P51955 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NEK2P51955 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEK2P51955 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEK2P51955 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEK2P51955 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEK2P51955 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEK2P51955 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEK2P51955 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEK2P51955 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEK2P51955 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEK2P51955 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEK2P51955 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEK2P51955 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEK2P51955 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEK2P51955 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEK2P51955 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK2P51955 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEK2P51955 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK2P51955 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK2P51955 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK2P51955 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK2P51955 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK2P51955 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEK2P51955 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK2P51955 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK2P51955 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEK2P51955 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEK2P51955 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK2P51955 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK2P51955 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEK2P51955 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEK2P51955 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK2P51955 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEK2P51955 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEK2P51955 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEK2P51955 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEK2P51955 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK2P51955 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEK2P51955 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK2P51955 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEK2P51955 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK2P51955 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NEK2P51955 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEK2P51955 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEK2P51955 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEK2P51955 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NEK2P51955 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NEK2P51955 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NEK2P51955 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK2P51955 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEK2P51955 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEK2P51955 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK2P51955 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEK2P51955 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEK2P51955 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEK2P51955 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEK2P51955 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEK2P51955 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEK2P51955 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEK2P51955 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK2P51955 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK2P51955 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK2P51955 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK2P51955 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NEK2P51955 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK2P51955 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK2P51955 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK2P51955 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEK2P51955 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK2P51955 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK2P51955 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK2P51955 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK2P51955 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK2P51955 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK2P51955 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK2P51955 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK2P51955 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK2P51955 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK2P51955 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK2P51955 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK2P51955 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK2P51955 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK2P51955 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK2P51955 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK2P51955 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK2P51955 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK2P51955 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK2P51955 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK2P51955 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK2P51955 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK2P51955 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK2P51955 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK2P51955 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK2P51955 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK2P51955 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms