Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
AFF1P51825 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
AFF1P51825 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
AFF1P51825 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AFF1P51825 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
AFF1P51825 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFF1P51825 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
AFF1P51825 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFF1P51825 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFF1P51825 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
AFF1P51825 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AFF1P51825 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AFF1P51825 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AFF1P51825 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
AFF1P51825 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AFF1P51825 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
AFF1P51825 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AFF1P51825 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AFF1P51825 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AFF1P51825 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AFF1P51825 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AFF1P51825 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AFF1P51825 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AFF1P51825 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AFF1P51825 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AFF1P51825 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AFF1P51825 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AFF1P51825 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AFF1P51825 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AFF1P51825 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AFF1P51825 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AFF1P51825 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AFF1P51825 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
AFF1P51825 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AFF1P51825 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AFF1P51825 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AFF1P51825 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AFF1P51825 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AFF1P51825 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AFF1P51825 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AFF1P51825 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AFF1P51825 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AFF1P51825 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AFF1P51825 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AFF1P51825 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFF1P51825 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFF1P51825 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFF1P51825 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
AFF1P51825 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
AFF1P51825 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFF1P51825 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
AFF1P51825 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
AFF1P51825 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
AFF1P51825 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AFF1P51825 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
AFF1P51825 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AFF1P51825 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
AFF1P51825 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
AFF1P51825 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
AFF1P51825 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFF1P51825 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFF1P51825 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
AFF1P51825 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
AFF1P51825 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFF1P51825 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
AFF1P51825 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AFF1P51825 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AFF1P51825 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AFF1P51825 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AFF1P51825 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFF1P51825 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFF1P51825 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFF1P51825 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFF1P51825 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AFF1P51825 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AFF1P51825 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AFF1P51825 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AFF1P51825 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
AFF1P51825 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
AFF1P51825 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
AFF1P51825 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AFF1P51825 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AFF1P51825 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AFF1P51825 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AFF1P51825 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AFF1P51825 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFF1P51825 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFF1P51825 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFF1P51825 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFF1P51825 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFF1P51825 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFF1P51825 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFF1P51825 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFF1P51825 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFF1P51825 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFF1P51825 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFF1P51825 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
AFF1P51825 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AFF1P51825 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AFF1P51825 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms