Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLXNA3P51805 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLXNA3P51805 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNA3P51805 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNA3P51805 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNA3P51805 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNA3P51805 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNA3P51805 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNA3P51805 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNA3P51805 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNA3P51805 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNA3P51805 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLXNA3P51805 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PLXNA3P51805 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLXNA3P51805 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNA3P51805 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNA3P51805 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLXNA3P51805 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNA3P51805 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLXNA3P51805 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNA3P51805 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLXNA3P51805 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNA3P51805 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLXNA3P51805 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLXNA3P51805 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNA3P51805 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLXNA3P51805 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNA3P51805 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNA3P51805 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNA3P51805 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLXNA3P51805 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLXNA3P51805 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNA3P51805 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNA3P51805 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PLXNA3P51805 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLXNA3P51805 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLXNA3P51805 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLXNA3P51805 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLXNA3P51805 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLXNA3P51805 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLXNA3P51805 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNA3P51805 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNA3P51805 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNA3P51805 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLXNA3P51805 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLXNA3P51805 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNA3P51805 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PLXNA3P51805 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PLXNA3P51805 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLXNA3P51805 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLXNA3P51805 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLXNA3P51805 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLXNA3P51805 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PLXNA3P51805 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms