Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCR3P51677 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCR3P51677 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCR3P51677 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCR3P51677 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCR3P51677 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCR3P51677 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCR3P51677 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCR3P51677 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCR3P51677 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCR3P51677 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCR3P51677 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCR3P51677 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCR3P51677 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCR3P51677 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCR3P51677 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCR3P51677 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCR3P51677 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCR3P51677 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCR3P51677 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCR3P51677 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCR3P51677 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCR3P51677 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCR3P51677 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCR3P51677 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCR3P51677 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCR3P51677 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCR3P51677 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCR3P51677 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCR3P51677 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCR3P51677 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCR3P51677 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCR3P51677 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCR3P51677 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCR3P51677 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCR3P51677 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCR3P51677 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCR3P51677 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCR3P51677 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCR3P51677 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCR3P51677 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCR3P51677 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCR3P51677 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCR3P51677 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCR3P51677 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCR3P51677 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCR3P51677 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCR3P51677 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCR3P51677 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCR3P51677 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCR3P51677 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCR3P51677 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCR3P51677 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCR3P51677 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCR3P51677 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCR3P51677 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCR3P51677 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCR3P51677 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCR3P51677 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCR3P51677 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCR3P51677 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCR3P51677 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCR3P51677 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCR3P51677 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCR3P51677 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCR3P51677 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCR3P51677 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCR3P51677 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCR3P51677 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCR3P51677 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCR3P51677 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCR3P51677 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCR3P51677 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCR3P51677 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCR3P51677 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCR3P51677 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCR3P51677 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCR3P51677 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCR3P51677 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCR3P51677 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCR3P51677 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCR3P51677 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCR3P51677 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCR3P51677 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCR3P51677 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCR3P51677 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCR3P51677 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCR3P51677 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCR3P51677 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCR3P51677 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCR3P51677 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCR3P51677 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCR3P51677 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCR3P51677 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCR3P51677 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCR3P51677 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCR3P51677 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCR3P51677 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCR3P51677 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCR3P51677 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms