Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB28P51157 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB28P51157 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB28P51157 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB28P51157 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB28P51157 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB28P51157 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB28P51157 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB28P51157 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB28P51157 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB28P51157 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB28P51157 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB28P51157 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB28P51157 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB28P51157 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB28P51157 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB28P51157 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB28P51157 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB28P51157 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB28P51157 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB28P51157 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB28P51157 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB28P51157 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB28P51157 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB28P51157 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB28P51157 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB28P51157 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB28P51157 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB28P51157 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB28P51157 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB28P51157 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB28P51157 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB28P51157 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB28P51157 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB28P51157 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB28P51157 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB28P51157 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB28P51157 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB28P51157 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB28P51157 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB28P51157 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB28P51157 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB28P51157 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB28P51157 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB28P51157 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB28P51157 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB28P51157 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB28P51157 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB28P51157 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB28P51157 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB28P51157 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB28P51157 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB28P51157 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB28P51157 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB28P51157 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB28P51157 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB28P51157 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB28P51157 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB28P51157 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB28P51157 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB28P51157 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB28P51157 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB28P51157 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB28P51157 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB28P51157 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB28P51157 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB28P51157 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB28P51157 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB28P51157 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB28P51157 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB28P51157 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB28P51157 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB28P51157 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB28P51157 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB28P51157 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB28P51157 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB28P51157 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB28P51157 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB28P51157 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB28P51157 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB28P51157 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB28P51157 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB28P51157 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB28P51157 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB28P51157 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB28P51157 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB28P51157 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB28P51157 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB28P51157 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB28P51157 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB28P51157 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB28P51157 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB28P51157 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB28P51157 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB28P51157 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB28P51157 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB28P51157 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB28P51157 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB28P51157 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB28P51157 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms