Protein–RNA interactions for Protein: P51153

RAB13, Ras-related protein Rab-13, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB13P51153 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB13P51153 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB13P51153 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB13P51153 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB13P51153 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB13P51153 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB13P51153 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB13P51153 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB13P51153 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB13P51153 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB13P51153 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB13P51153 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB13P51153 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB13P51153 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB13P51153 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB13P51153 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB13P51153 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB13P51153 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB13P51153 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB13P51153 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB13P51153 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB13P51153 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB13P51153 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB13P51153 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB13P51153 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB13P51153 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB13P51153 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB13P51153 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB13P51153 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB13P51153 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB13P51153 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB13P51153 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB13P51153 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB13P51153 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB13P51153 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB13P51153 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB13P51153 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB13P51153 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB13P51153 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB13P51153 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB13P51153 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB13P51153 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB13P51153 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB13P51153 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB13P51153 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB13P51153 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB13P51153 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB13P51153 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB13P51153 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB13P51153 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB13P51153 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB13P51153 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB13P51153 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB13P51153 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB13P51153 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB13P51153 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB13P51153 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB13P51153 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB13P51153 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB13P51153 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB13P51153 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB13P51153 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB13P51153 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB13P51153 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB13P51153 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB13P51153 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB13P51153 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB13P51153 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB13P51153 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB13P51153 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB13P51153 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB13P51153 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB13P51153 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB13P51153 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB13P51153 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB13P51153 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB13P51153 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB13P51153 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB13P51153 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB13P51153 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB13P51153 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB13P51153 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB13P51153 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB13P51153 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB13P51153 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB13P51153 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB13P51153 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB13P51153 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB13P51153 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB13P51153 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB13P51153 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB13P51153 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB13P51153 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB13P51153 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB13P51153 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB13P51153 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB13P51153 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB13P51153 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB13P51153 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB13P51153 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms