Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPT1P50897 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPT1P50897 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPT1P50897 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPT1P50897 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPT1P50897 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPT1P50897 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPT1P50897 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPT1P50897 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPT1P50897 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPT1P50897 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPT1P50897 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPT1P50897 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPT1P50897 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPT1P50897 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPT1P50897 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPT1P50897 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPT1P50897 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPT1P50897 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPT1P50897 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPT1P50897 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPT1P50897 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPT1P50897 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPT1P50897 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPT1P50897 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPT1P50897 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPT1P50897 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPT1P50897 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPT1P50897 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPT1P50897 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPT1P50897 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPT1P50897 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPT1P50897 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPT1P50897 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPT1P50897 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPT1P50897 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPT1P50897 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT1P50897 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT1P50897 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPT1P50897 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT1P50897 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPT1P50897 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT1P50897 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT1P50897 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT1P50897 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPT1P50897 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPT1P50897 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT1P50897 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT1P50897 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT1P50897 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPT1P50897 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT1P50897 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPT1P50897 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT1P50897 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PPT1P50897 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPT1P50897 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPT1P50897 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPT1P50897 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT1P50897 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPT1P50897 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPT1P50897 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPT1P50897 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT1P50897 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT1P50897 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT1P50897 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT1P50897 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT1P50897 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT1P50897 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPT1P50897 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPT1P50897 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPT1P50897 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPT1P50897 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPT1P50897 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPT1P50897 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPT1P50897 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPT1P50897 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPT1P50897 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPT1P50897 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPT1P50897 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPT1P50897 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPT1P50897 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPT1P50897 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPT1P50897 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPT1P50897 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPT1P50897 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPT1P50897 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPT1P50897 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPT1P50897 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPT1P50897 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPT1P50897 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPT1P50897 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPT1P50897 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPT1P50897 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPT1P50897 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPT1P50897 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPT1P50897 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPT1P50897 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPT1P50897 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPT1P50897 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPT1P50897 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms