Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnnt2P50752 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt2P50752 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnnt2P50752 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnnt2P50752 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt2P50752 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt2P50752 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnnt2P50752 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt2P50752 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt2P50752 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt2P50752 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt2P50752 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt2P50752 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnnt2P50752 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnnt2P50752 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnnt2P50752 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnnt2P50752 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnnt2P50752 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Tnnt2P50752 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnnt2P50752 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnnt2P50752 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnnt2P50752 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnt2P50752 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnnt2P50752 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnnt2P50752 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnnt2P50752 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnnt2P50752 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnnt2P50752 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tnnt2P50752 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt2P50752 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tnnt2P50752 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnnt2P50752 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tnnt2P50752 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt2P50752 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tnnt2P50752 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tnnt2P50752 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tnnt2P50752 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tnnt2P50752 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tnnt2P50752 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnt2P50752 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tnnt2P50752 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tnnt2P50752 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnnt2P50752 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnnt2P50752 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tnnt2P50752 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt2P50752 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt2P50752 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tnnt2P50752 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tnnt2P50752 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms