Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HLCSP50747 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLCSP50747 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLCSP50747 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLCSP50747 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLCSP50747 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLCSP50747 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLCSP50747 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLCSP50747 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLCSP50747 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HLCSP50747 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLCSP50747 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLCSP50747 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLCSP50747 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HLCSP50747 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLCSP50747 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLCSP50747 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLCSP50747 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLCSP50747 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLCSP50747 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLCSP50747 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HLCSP50747 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HLCSP50747 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLCSP50747 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HLCSP50747 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HLCSP50747 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HLCSP50747 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HLCSP50747 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HLCSP50747 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HLCSP50747 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLCSP50747 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLCSP50747 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLCSP50747 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLCSP50747 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HLCSP50747 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLCSP50747 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLCSP50747 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLCSP50747 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HLCSP50747 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLCSP50747 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLCSP50747 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLCSP50747 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLCSP50747 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLCSP50747 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HLCSP50747 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLCSP50747 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLCSP50747 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HLCSP50747 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HLCSP50747 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLCSP50747 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HLCSP50747 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HLCSP50747 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLCSP50747 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HLCSP50747 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HLCSP50747 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLCSP50747 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLCSP50747 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLCSP50747 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HLCSP50747 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HLCSP50747 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HLCSP50747 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLCSP50747 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLCSP50747 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLCSP50747 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLCSP50747 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLCSP50747 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HLCSP50747 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HLCSP50747 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HLCSP50747 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLCSP50747 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLCSP50747 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLCSP50747 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLCSP50747 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HLCSP50747 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HLCSP50747 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HLCSP50747 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HLCSP50747 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLCSP50747 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HLCSP50747 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLCSP50747 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLCSP50747 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HLCSP50747 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLCSP50747 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HLCSP50747 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLCSP50747 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLCSP50747 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HLCSP50747 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HLCSP50747 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HLCSP50747 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLCSP50747 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLCSP50747 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HLCSP50747 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLCSP50747 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLCSP50747 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLCSP50747 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLCSP50747 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLCSP50747 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLCSP50747 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLCSP50747 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLCSP50747 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms