Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa6P50704 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa6P50704 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa6P50704 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa6P50704 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa6P50704 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa6P50704 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa6P50704 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa6P50704 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa6P50704 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa6P50704 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa6P50704 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa6P50704 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa6P50704 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa6P50704 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa6P50704 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa6P50704 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa6P50704 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Defa6P50704 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa6P50704 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa6P50704 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa6P50704 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa6P50704 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa6P50704 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa6P50704 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa6P50704 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa6P50704 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa6P50704 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa6P50704 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms