Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TspoP50637 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TspoP50637 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TspoP50637 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TspoP50637 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TspoP50637 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TspoP50637 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TspoP50637 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TspoP50637 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TspoP50637 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TspoP50637 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TspoP50637 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TspoP50637 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TspoP50637 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TspoP50637 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TspoP50637 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TspoP50637 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TspoP50637 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TspoP50637 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TspoP50637 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TspoP50637 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TspoP50637 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TspoP50637 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TspoP50637 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TspoP50637 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TspoP50637 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TspoP50637 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TspoP50637 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TspoP50637 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TspoP50637 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TspoP50637 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TspoP50637 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TspoP50637 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TspoP50637 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TspoP50637 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TspoP50637 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TspoP50637 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TspoP50637 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TspoP50637 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TspoP50637 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TspoP50637 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TspoP50637 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TspoP50637 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TspoP50637 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TspoP50637 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TspoP50637 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TspoP50637 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TspoP50637 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TspoP50637 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TspoP50637 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TspoP50637 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TspoP50637 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TspoP50637 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TspoP50637 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TspoP50637 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TspoP50637 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TspoP50637 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TspoP50637 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TspoP50637 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TspoP50637 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TspoP50637 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TspoP50637 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TspoP50637 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TspoP50637 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TspoP50637 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TspoP50637 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TspoP50637 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TspoP50637 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TspoP50637 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TspoP50637 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TspoP50637 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TspoP50637 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TspoP50637 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TspoP50637 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TspoP50637 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TspoP50637 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TspoP50637 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TspoP50637 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TspoP50637 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TspoP50637 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TspoP50637 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TspoP50637 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TspoP50637 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TspoP50637 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TspoP50637 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TspoP50637 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TspoP50637 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TspoP50637 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TspoP50637 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TspoP50637 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TspoP50637 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TspoP50637 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TspoP50637 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TspoP50637 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TspoP50637 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TspoP50637 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TspoP50637 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TspoP50637 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TspoP50637 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TspoP50637 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms