Protein–RNA interactions for Protein: P50636

Rnf19a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19aP50636 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf19aP50636 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf19aP50636 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf19aP50636 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf19aP50636 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf19aP50636 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf19aP50636 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf19aP50636 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf19aP50636 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf19aP50636 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf19aP50636 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf19aP50636 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnf19aP50636 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf19aP50636 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf19aP50636 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf19aP50636 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf19aP50636 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf19aP50636 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf19aP50636 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnf19aP50636 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rnf19aP50636 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf19aP50636 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf19aP50636 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rnf19aP50636 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rnf19aP50636 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf19aP50636 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rnf19aP50636 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf19aP50636 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rnf19aP50636 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rnf19aP50636 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rnf19aP50636 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf19aP50636 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf19aP50636 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rnf19aP50636 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf19aP50636 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rnf19aP50636 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rnf19aP50636 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf19aP50636 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf19aP50636 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rnf19aP50636 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rnf19aP50636 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rnf19aP50636 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rnf19aP50636 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rnf19aP50636 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf19aP50636 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rnf19aP50636 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf19aP50636 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rnf19aP50636 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rnf19aP50636 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rnf19aP50636 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf19aP50636 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rnf19aP50636 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf19aP50636 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rnf19aP50636 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rnf19aP50636 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rnf19aP50636 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf19aP50636 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rnf19aP50636 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rnf19aP50636 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf19aP50636 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rnf19aP50636 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf19aP50636 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf19aP50636 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rnf19aP50636 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rnf19aP50636 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rnf19aP50636 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf19aP50636 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rnf19aP50636 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf19aP50636 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf19aP50636 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf19aP50636 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rnf19aP50636 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf19aP50636 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf19aP50636 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rnf19aP50636 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms