Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERFP50548 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERFP50548 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERFP50548 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERFP50548 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERFP50548 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERFP50548 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERFP50548 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERFP50548 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERFP50548 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERFP50548 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ERFP50548 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERFP50548 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERFP50548 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERFP50548 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERFP50548 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERFP50548 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERFP50548 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERFP50548 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERFP50548 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERFP50548 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERFP50548 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERFP50548 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERFP50548 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERFP50548 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERFP50548 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERFP50548 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERFP50548 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERFP50548 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERFP50548 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERFP50548 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERFP50548 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERFP50548 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERFP50548 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERFP50548 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERFP50548 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERFP50548 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERFP50548 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERFP50548 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERFP50548 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERFP50548 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERFP50548 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERFP50548 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERFP50548 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERFP50548 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERFP50548 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERFP50548 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERFP50548 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERFP50548 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERFP50548 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERFP50548 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ERFP50548 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERFP50548 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERFP50548 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERFP50548 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERFP50548 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERFP50548 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERFP50548 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERFP50548 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERFP50548 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERFP50548 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERFP50548 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERFP50548 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERFP50548 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERFP50548 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERFP50548 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERFP50548 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERFP50548 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERFP50548 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERFP50548 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERFP50548 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERFP50548 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERFP50548 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERFP50548 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERFP50548 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERFP50548 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERFP50548 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERFP50548 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERFP50548 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERFP50548 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERFP50548 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERFP50548 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERFP50548 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERFP50548 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERFP50548 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERFP50548 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERFP50548 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERFP50548 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERFP50548 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERFP50548 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERFP50548 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERFP50548 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERFP50548 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERFP50548 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERFP50548 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERFP50548 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERFP50548 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERFP50548 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERFP50548 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERFP50548 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms