Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPAP49450 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPAP49450 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPAP49450 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPAP49450 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPAP49450 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPAP49450 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPAP49450 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPAP49450 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPAP49450 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPAP49450 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPAP49450 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPAP49450 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPAP49450 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPAP49450 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPAP49450 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPAP49450 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPAP49450 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPAP49450 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPAP49450 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPAP49450 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPAP49450 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPAP49450 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPAP49450 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPAP49450 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPAP49450 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPAP49450 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPAP49450 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPAP49450 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CENPAP49450 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CENPAP49450 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPAP49450 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPAP49450 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CENPAP49450 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CENPAP49450 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CENPAP49450 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPAP49450 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPAP49450 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPAP49450 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPAP49450 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPAP49450 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPAP49450 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPAP49450 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPAP49450 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPAP49450 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPAP49450 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPAP49450 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPAP49450 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPAP49450 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPAP49450 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPAP49450 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPAP49450 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPAP49450 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPAP49450 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPAP49450 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPAP49450 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPAP49450 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPAP49450 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPAP49450 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPAP49450 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPAP49450 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPAP49450 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPAP49450 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPAP49450 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPAP49450 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPAP49450 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPAP49450 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPAP49450 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPAP49450 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPAP49450 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPAP49450 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPAP49450 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPAP49450 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPAP49450 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPAP49450 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPAP49450 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPAP49450 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPAP49450 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPAP49450 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPAP49450 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPAP49450 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPAP49450 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPAP49450 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPAP49450 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPAP49450 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPAP49450 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPAP49450 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPAP49450 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CENPAP49450 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPAP49450 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CENPAP49450 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPAP49450 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPAP49450 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CENPAP49450 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPAP49450 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPAP49450 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CENPAP49450 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPAP49450 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPAP49450 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPAP49450 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms