Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FNTAP49354 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FNTAP49354 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNTAP49354 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNTAP49354 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNTAP49354 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNTAP49354 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNTAP49354 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FNTAP49354 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FNTAP49354 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FNTAP49354 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FNTAP49354 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FNTAP49354 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FNTAP49354 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNTAP49354 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNTAP49354 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNTAP49354 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNTAP49354 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNTAP49354 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FNTAP49354 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FNTAP49354 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FNTAP49354 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FNTAP49354 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FNTAP49354 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FNTAP49354 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FNTAP49354 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FNTAP49354 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FNTAP49354 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FNTAP49354 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FNTAP49354 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FNTAP49354 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FNTAP49354 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FNTAP49354 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FNTAP49354 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FNTAP49354 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FNTAP49354 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FNTAP49354 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FNTAP49354 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FNTAP49354 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FNTAP49354 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FNTAP49354 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FNTAP49354 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FNTAP49354 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FNTAP49354 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FNTAP49354 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FNTAP49354 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FNTAP49354 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FNTAP49354 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FNTAP49354 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FNTAP49354 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FNTAP49354 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FNTAP49354 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FNTAP49354 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FNTAP49354 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FNTAP49354 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FNTAP49354 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FNTAP49354 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FNTAP49354 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FNTAP49354 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FNTAP49354 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FNTAP49354 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNTAP49354 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNTAP49354 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNTAP49354 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FNTAP49354 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FNTAP49354 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FNTAP49354 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FNTAP49354 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FNTAP49354 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FNTAP49354 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FNTAP49354 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FNTAP49354 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FNTAP49354 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FNTAP49354 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FNTAP49354 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FNTAP49354 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FNTAP49354 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FNTAP49354 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FNTAP49354 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FNTAP49354 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FNTAP49354 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FNTAP49354 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FNTAP49354 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FNTAP49354 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FNTAP49354 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FNTAP49354 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FNTAP49354 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FNTAP49354 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FNTAP49354 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FNTAP49354 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FNTAP49354 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FNTAP49354 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FNTAP49354 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FNTAP49354 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FNTAP49354 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FNTAP49354 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FNTAP49354 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FNTAP49354 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNTAP49354 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNTAP49354 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms