Protein–RNA interactions for Protein: P48736

PIK3CG, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CGP48736 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3CGP48736 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3CGP48736 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3CGP48736 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CGP48736 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CGP48736 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CGP48736 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CGP48736 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CGP48736 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CGP48736 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIK3CGP48736 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIK3CGP48736 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIK3CGP48736 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CGP48736 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CGP48736 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CGP48736 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CGP48736 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIK3CGP48736 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIK3CGP48736 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIK3CGP48736 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIK3CGP48736 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIK3CGP48736 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIK3CGP48736 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIK3CGP48736 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIK3CGP48736 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIK3CGP48736 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIK3CGP48736 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIK3CGP48736 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIK3CGP48736 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIK3CGP48736 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIK3CGP48736 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIK3CGP48736 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIK3CGP48736 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIK3CGP48736 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIK3CGP48736 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PIK3CGP48736 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIK3CGP48736 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIK3CGP48736 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIK3CGP48736 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIK3CGP48736 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIK3CGP48736 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIK3CGP48736 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CGP48736 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CGP48736 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIK3CGP48736 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CGP48736 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIK3CGP48736 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CGP48736 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PIK3CGP48736 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3CGP48736 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIK3CGP48736 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIK3CGP48736 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3CGP48736 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CGP48736 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CGP48736 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3CGP48736 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3CGP48736 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CGP48736 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CGP48736 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CGP48736 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CGP48736 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3CGP48736 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CGP48736 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CGP48736 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PIK3CGP48736 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CGP48736 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIK3CGP48736 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIK3CGP48736 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PIK3CGP48736 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms