Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMTP48728 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMTP48728 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMTP48728 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMTP48728 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMTP48728 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMTP48728 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMTP48728 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMTP48728 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMTP48728 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMTP48728 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMTP48728 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMTP48728 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMTP48728 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMTP48728 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AMTP48728 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMTP48728 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AMTP48728 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AMTP48728 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AMTP48728 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AMTP48728 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AMTP48728 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMTP48728 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMTP48728 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMTP48728 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMTP48728 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AMTP48728 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMTP48728 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMTP48728 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMTP48728 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMTP48728 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AMTP48728 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMTP48728 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMTP48728 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AMTP48728 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMTP48728 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AMTP48728 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMTP48728 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AMTP48728 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMTP48728 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMTP48728 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMTP48728 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AMTP48728 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMTP48728 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMTP48728 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AMTP48728 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMTP48728 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMTP48728 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMTP48728 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AMTP48728 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMTP48728 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMTP48728 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMTP48728 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMTP48728 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMTP48728 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMTP48728 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMTP48728 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMTP48728 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMTP48728 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMTP48728 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMTP48728 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMTP48728 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMTP48728 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMTP48728 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMTP48728 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMTP48728 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMTP48728 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMTP48728 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMTP48728 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMTP48728 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMTP48728 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMTP48728 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMTP48728 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMTP48728 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMTP48728 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMTP48728 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMTP48728 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMTP48728 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMTP48728 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AMTP48728 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMTP48728 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AMTP48728 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMTP48728 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AMTP48728 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMTP48728 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AMTP48728 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMTP48728 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMTP48728 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AMTP48728 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMTP48728 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AMTP48728 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AMTP48728 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMTP48728 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AMTP48728 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AMTP48728 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMTP48728 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMTP48728 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMTP48728 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMTP48728 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMTP48728 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms