Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcd1P48410 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcd1P48410 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcd1P48410 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcd1P48410 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcd1P48410 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcd1P48410 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcd1P48410 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcd1P48410 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcd1P48410 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcd1P48410 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcd1P48410 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcd1P48410 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcd1P48410 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcd1P48410 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcd1P48410 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcd1P48410 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcd1P48410 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcd1P48410 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcd1P48410 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcd1P48410 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcd1P48410 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcd1P48410 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcd1P48410 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abcd1P48410 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abcd1P48410 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abcd1P48410 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcd1P48410 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcd1P48410 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Abcd1P48410 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abcd1P48410 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abcd1P48410 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcd1P48410 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcd1P48410 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Abcd1P48410 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abcd1P48410 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcd1P48410 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcd1P48410 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcd1P48410 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Abcd1P48410 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Abcd1P48410 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abcd1P48410 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abcd1P48410 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Abcd1P48410 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Abcd1P48410 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcd1P48410 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcd1P48410 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcd1P48410 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcd1P48410 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcd1P48410 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcd1P48410 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcd1P48410 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcd1P48410 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcd1P48410 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcd1P48410 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcd1P48410 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcd1P48410 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcd1P48410 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms