Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Edn3P48299 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edn3P48299 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edn3P48299 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edn3P48299 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edn3P48299 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edn3P48299 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edn3P48299 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Edn3P48299 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edn3P48299 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Edn3P48299 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Edn3P48299 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Edn3P48299 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Edn3P48299 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Edn3P48299 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edn3P48299 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edn3P48299 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edn3P48299 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edn3P48299 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edn3P48299 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edn3P48299 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edn3P48299 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edn3P48299 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Edn3P48299 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Edn3P48299 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Edn3P48299 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Edn3P48299 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Edn3P48299 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edn3P48299 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Edn3P48299 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Edn3P48299 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Edn3P48299 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Edn3P48299 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Edn3P48299 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Edn3P48299 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edn3P48299 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Edn3P48299 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Edn3P48299 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edn3P48299 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edn3P48299 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Edn3P48299 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Edn3P48299 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edn3P48299 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edn3P48299 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Edn3P48299 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Edn3P48299 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Edn3P48299 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Edn3P48299 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Edn3P48299 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Edn3P48299 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Edn3P48299 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Edn3P48299 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Edn3P48299 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Edn3P48299 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Edn3P48299 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Edn3P48299 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Edn3P48299 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Edn3P48299 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Edn3P48299 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Edn3P48299 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edn3P48299 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms