Protein–RNA interactions for Protein: P48060

GLIPR1, Glioma pathogenesis-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIPR1P48060 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GLIPR1P48060 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLIPR1P48060 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLIPR1P48060 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLIPR1P48060 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLIPR1P48060 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLIPR1P48060 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLIPR1P48060 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GLIPR1P48060 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GLIPR1P48060 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLIPR1P48060 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GLIPR1P48060 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLIPR1P48060 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLIPR1P48060 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GLIPR1P48060 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLIPR1P48060 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLIPR1P48060 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLIPR1P48060 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLIPR1P48060 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLIPR1P48060 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GLIPR1P48060 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GLIPR1P48060 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLIPR1P48060 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLIPR1P48060 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLIPR1P48060 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLIPR1P48060 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLIPR1P48060 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLIPR1P48060 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLIPR1P48060 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLIPR1P48060 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLIPR1P48060 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLIPR1P48060 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLIPR1P48060 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLIPR1P48060 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GLIPR1P48060 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GLIPR1P48060 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GLIPR1P48060 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLIPR1P48060 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLIPR1P48060 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLIPR1P48060 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLIPR1P48060 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GLIPR1P48060 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GLIPR1P48060 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GLIPR1P48060 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GLIPR1P48060 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLIPR1P48060 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLIPR1P48060 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLIPR1P48060 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLIPR1P48060 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLIPR1P48060 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLIPR1P48060 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLIPR1P48060 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLIPR1P48060 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLIPR1P48060 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLIPR1P48060 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLIPR1P48060 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms