Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP5OP48047 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP5OP48047 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP5OP48047 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP5OP48047 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP5OP48047 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP5OP48047 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP5OP48047 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP5OP48047 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP5OP48047 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP5OP48047 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP5OP48047 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP5OP48047 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP5OP48047 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP5OP48047 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP5OP48047 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP5OP48047 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP5OP48047 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP5OP48047 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP5OP48047 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP5OP48047 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP5OP48047 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP5OP48047 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP5OP48047 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP5OP48047 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP5OP48047 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP5OP48047 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP5OP48047 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP5OP48047 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP5OP48047 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP5OP48047 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP5OP48047 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP5OP48047 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP5OP48047 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP5OP48047 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP5OP48047 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP5OP48047 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP5OP48047 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP5OP48047 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP5OP48047 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP5OP48047 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP5OP48047 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP5OP48047 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP5OP48047 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP5OP48047 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP5OP48047 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP5OP48047 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP5OP48047 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP5OP48047 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP5OP48047 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP5OP48047 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP5OP48047 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP5OP48047 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP5OP48047 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP5OP48047 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP5OP48047 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP5OP48047 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP5OP48047 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP5OP48047 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP5OP48047 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP5OP48047 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP5OP48047 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATP5OP48047 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP5OP48047 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP5OP48047 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP5OP48047 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP5OP48047 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP5OP48047 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP5OP48047 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP5OP48047 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP5OP48047 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP5OP48047 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP5OP48047 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms