Protein–RNA interactions for Protein: P47755

CAPZA2, F-actin-capping protein subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA2P47755 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPZA2P47755 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA2P47755 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA2P47755 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA2P47755 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA2P47755 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA2P47755 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPZA2P47755 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPZA2P47755 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPZA2P47755 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPZA2P47755 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPZA2P47755 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPZA2P47755 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPZA2P47755 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPZA2P47755 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPZA2P47755 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPZA2P47755 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPZA2P47755 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPZA2P47755 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPZA2P47755 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPZA2P47755 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPZA2P47755 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPZA2P47755 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPZA2P47755 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPZA2P47755 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPZA2P47755 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPZA2P47755 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPZA2P47755 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms