Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GALR1P47211 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GALR1P47211 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GALR1P47211 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GALR1P47211 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GALR1P47211 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALR1P47211 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALR1P47211 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GALR1P47211 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALR1P47211 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GALR1P47211 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GALR1P47211 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALR1P47211 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALR1P47211 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALR1P47211 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GALR1P47211 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALR1P47211 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALR1P47211 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GALR1P47211 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GALR1P47211 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALR1P47211 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALR1P47211 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GALR1P47211 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GALR1P47211 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GALR1P47211 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GALR1P47211 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GALR1P47211 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GALR1P47211 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GALR1P47211 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GALR1P47211 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GALR1P47211 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GALR1P47211 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GALR1P47211 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GALR1P47211 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GALR1P47211 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GALR1P47211 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GALR1P47211 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GALR1P47211 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GALR1P47211 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALR1P47211 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALR1P47211 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALR1P47211 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALR1P47211 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALR1P47211 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALR1P47211 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GALR1P47211 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALR1P47211 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GALR1P47211 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GALR1P47211 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GALR1P47211 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GALR1P47211 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GALR1P47211 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GALR1P47211 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GALR1P47211 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GALR1P47211 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GALR1P47211 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GALR1P47211 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GALR1P47211 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GALR1P47211 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GALR1P47211 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GALR1P47211 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALR1P47211 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALR1P47211 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALR1P47211 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALR1P47211 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GALR1P47211 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GALR1P47211 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GALR1P47211 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GALR1P47211 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GALR1P47211 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GALR1P47211 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GALR1P47211 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GALR1P47211 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GALR1P47211 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GALR1P47211 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GALR1P47211 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GALR1P47211 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GALR1P47211 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GALR1P47211 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GALR1P47211 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GALR1P47211 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GALR1P47211 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GALR1P47211 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GALR1P47211 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GALR1P47211 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GALR1P47211 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GALR1P47211 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GALR1P47211 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GALR1P47211 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GALR1P47211 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GALR1P47211 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALR1P47211 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALR1P47211 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GALR1P47211 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALR1P47211 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GALR1P47211 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALR1P47211 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALR1P47211 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALR1P47211 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GALR1P47211 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms