Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stt3aP46978 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stt3aP46978 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stt3aP46978 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stt3aP46978 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stt3aP46978 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stt3aP46978 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stt3aP46978 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stt3aP46978 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stt3aP46978 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stt3aP46978 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stt3aP46978 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stt3aP46978 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stt3aP46978 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stt3aP46978 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stt3aP46978 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Stt3aP46978 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stt3aP46978 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stt3aP46978 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stt3aP46978 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stt3aP46978 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stt3aP46978 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stt3aP46978 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stt3aP46978 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stt3aP46978 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stt3aP46978 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stt3aP46978 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stt3aP46978 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stt3aP46978 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stt3aP46978 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stt3aP46978 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stt3aP46978 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stt3aP46978 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stt3aP46978 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stt3aP46978 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stt3aP46978 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stt3aP46978 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Stt3aP46978 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stt3aP46978 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stt3aP46978 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stt3aP46978 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Stt3aP46978 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stt3aP46978 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stt3aP46978 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stt3aP46978 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stt3aP46978 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stt3aP46978 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stt3aP46978 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stt3aP46978 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stt3aP46978 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Stt3aP46978 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Stt3aP46978 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stt3aP46978 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stt3aP46978 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stt3aP46978 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stt3aP46978 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stt3aP46978 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stt3aP46978 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stt3aP46978 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stt3aP46978 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stt3aP46978 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stt3aP46978 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stt3aP46978 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stt3aP46978 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms