Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec3bP43025 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec3bP43025 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec3bP43025 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec3bP43025 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec3bP43025 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec3bP43025 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec3bP43025 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec3bP43025 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec3bP43025 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clec3bP43025 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clec3bP43025 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clec3bP43025 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clec3bP43025 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clec3bP43025 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec3bP43025 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec3bP43025 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec3bP43025 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clec3bP43025 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec3bP43025 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clec3bP43025 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clec3bP43025 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clec3bP43025 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clec3bP43025 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clec3bP43025 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec3bP43025 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clec3bP43025 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec3bP43025 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Clec3bP43025 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clec3bP43025 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
Clec3bP43025 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clec3bP43025 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec3bP43025 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Clec3bP43025 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec3bP43025 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clec3bP43025 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clec3bP43025 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clec3bP43025 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clec3bP43025 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clec3bP43025 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms