Protein–RNA interactions for Protein: P41731

Cd63, CD63 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd63P41731 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd63P41731 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd63P41731 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd63P41731 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd63P41731 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd63P41731 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd63P41731 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd63P41731 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd63P41731 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd63P41731 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd63P41731 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd63P41731 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd63P41731 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd63P41731 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd63P41731 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd63P41731 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd63P41731 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd63P41731 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd63P41731 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd63P41731 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd63P41731 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd63P41731 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd63P41731 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd63P41731 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd63P41731 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd63P41731 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd63P41731 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd63P41731 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd63P41731 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd63P41731 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd63P41731 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd63P41731 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd63P41731 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd63P41731 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd63P41731 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd63P41731 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd63P41731 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd63P41731 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd63P41731 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd63P41731 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd63P41731 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd63P41731 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd63P41731 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd63P41731 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd63P41731 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd63P41731 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd63P41731 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd63P41731 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd63P41731 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd63P41731 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd63P41731 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd63P41731 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd63P41731 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd63P41731 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd63P41731 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd63P41731 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd63P41731 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd63P41731 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd63P41731 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd63P41731 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd63P41731 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd63P41731 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd63P41731 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd63P41731 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd63P41731 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd63P41731 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd63P41731 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd63P41731 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd63P41731 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd63P41731 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd63P41731 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd63P41731 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd63P41731 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd63P41731 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms