Protein–RNA interactions for Protein: P40926

MDH2, Malate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH2P40926 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH2P40926 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH2P40926 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH2P40926 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH2P40926 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDH2P40926 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDH2P40926 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDH2P40926 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH2P40926 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH2P40926 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH2P40926 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MDH2P40926 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MDH2P40926 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MDH2P40926 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDH2P40926 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDH2P40926 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDH2P40926 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDH2P40926 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDH2P40926 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDH2P40926 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDH2P40926 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDH2P40926 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH2P40926 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH2P40926 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH2P40926 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH2P40926 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH2P40926 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDH2P40926 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDH2P40926 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDH2P40926 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MDH2P40926 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDH2P40926 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDH2P40926 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDH2P40926 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDH2P40926 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDH2P40926 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDH2P40926 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH2P40926 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH2P40926 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDH2P40926 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH2P40926 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH2P40926 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDH2P40926 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MDH2P40926 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDH2P40926 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MDH2P40926 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH2P40926 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH2P40926 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH2P40926 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDH2P40926 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDH2P40926 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MDH2P40926 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDH2P40926 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDH2P40926 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDH2P40926 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDH2P40926 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDH2P40926 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDH2P40926 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDH2P40926 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDH2P40926 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH2P40926 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDH2P40926 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDH2P40926 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDH2P40926 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDH2P40926 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDH2P40926 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDH2P40926 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MDH2P40926 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDH2P40926 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDH2P40926 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH2P40926 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH2P40926 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDH2P40926 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH2P40926 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH2P40926 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDH2P40926 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH2P40926 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH2P40926 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH2P40926 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH2P40926 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDH2P40926 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDH2P40926 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDH2P40926 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDH2P40926 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDH2P40926 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDH2P40926 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDH2P40926 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH2P40926 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH2P40926 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH2P40926 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDH2P40926 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDH2P40926 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDH2P40926 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDH2P40926 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH2P40926 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDH2P40926 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH2P40926 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDH2P40926 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDH2P40926 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDH2P40926 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms