Protein–RNA interactions for Protein: P40505

SDS3, Transcriptional regulatory protein SDS3, yeastyeast

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SDS3P40505 YJL225CYJL225C 5277 nt10.74□□□□□ -0.69
SDS3P40505 YGL034CYGL034C 366 nt10.72□□□□□ -0.69
SDS3P40505 TOM6YOR045W 186 nt10.7□□□□□ -0.7
SDS3P40505 ATG15YCR068W 1563 nt10.69□□□□□ -0.7
SDS3P40505 YCR087WYCR087W 516 nt10.69□□□□□ -0.7
SDS3P40505 MRP20YDR405W 792 nt10.69□□□□□ -0.7
SDS3P40505 LSC2YGR244C 1284 nt10.69□□□□□ -0.7
SDS3P40505 POM34YLR018C 900 nt10.69□□□□□ -0.7
SDS3P40505 BIO5YNR056C 1686 nt10.69□□□□□ -0.7
SDS3P40505 GAP1YKR039W 1809 nt10.68□□□□□ -0.7
SDS3P40505 COQ2YNR041C 1119 nt10.67□□□□□ -0.7
SDS3P40505 PEX2YJL210W 816 nt10.64□□□□□ -0.71
SDS3P40505 YML089CYML089C 369 nt10.63□□□□□ -0.71
SDS3P40505 UTR1YJR049C 1593 nt10.62□□□□□ -0.71
SDS3P40505 PRM5YIL117C 957 nt10.62□□□□□ -0.71
SDS3P40505 RBG1YAL036C 1110 nt10.61□□□□□ -0.71
SDS3P40505 AIM45YPR004C 1035 nt10.6□□□□□ -0.71
SDS3P40505 NDI1YML120C 1542 nt10.55□□□□□ -0.72
SDS3P40505 HIP1YGR191W 1812 nt10.54□□□□□ -0.72
SDS3P40505 SAM35YHR083W 990 nt10.54□□□□□ -0.72
SDS3P40505 NAR1YNL240C 1476 nt10.54□□□□□ -0.72
SDS3P40505 RPL4BYDR012W 1089 nt10.53□□□□□ -0.72
SDS3P40505 CLB6YGR109C 1143 nt10.53□□□□□ -0.72
SDS3P40505 RPL4AYBR031W 1089 nt10.53□□□□□ -0.72
SDS3P40505 TIF6YPR016C 738 nt10.53□□□□□ -0.72
SDS3P40505 YMR244WYMR244W 1068 nt10.52□□□□□ -0.73
SDS3P40505 NRT1YOR071C 1797 nt10.5□□□□□ -0.73
SDS3P40505 UTH1YKR042W 1098 nt10.5□□□□□ -0.73
SDS3P40505 ALD4YOR374W 1560 nt10.5□□□□□ -0.73
SDS3P40505 MET28YIR017C 564 nt10.48□□□□□ -0.73
SDS3P40505 HIF1YLL022C 1158 nt10.48□□□□□ -0.73
SDS3P40505 DIF1YLR437C 402 nt10.48□□□□□ -0.73
SDS3P40505 RPS14BYJL191W 417 nt10.45□□□□□ -0.74
SDS3P40505 PBP1YGR178C 2169 nt10.43□□□□□ -0.74
SDS3P40505 SDH5YOL071W 489 nt10.42□□□□□ -0.74
SDS3P40505 CYT2YKL087C 675 nt10.41□□□□□ -0.74
SDS3P40505 YAR028WYAR028W 705 nt10.4□□□□□ -0.74
SDS3P40505 GLR1YPL091W 1452 nt10.37□□□□□ -0.75
SDS3P40505 SSN3YPL042C 1668 nt10.37□□□□□ -0.75
SDS3P40505 AKR2YOR034C 2250 nt10.36□□□□□ -0.75
SDS3P40505 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.35□□□□□ -0.75
SDS3P40505 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.35□□□□□ -0.75
SDS3P40505 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.35□□□□□ -0.75
SDS3P40505 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.35□□□□□ -0.75
SDS3P40505 FIT3YOR383C 615 nt10.35□□□□□ -0.75
SDS3P40505 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.35□□□□□ -0.75
SDS3P40505 HXT1YHR094C 1713 nt10.35□□□□□ -0.75
SDS3P40505 ZTA1YBR046C 1005 nt10.34□□□□□ -0.75
SDS3P40505 MTG2YHR168W 1557 nt10.34□□□□□ -0.75
SDS3P40505 TSC10YBR265W 963 nt10.33□□□□□ -0.76
SDS3P40505 RBG2YGR173W 1107 nt10.32□□□□□ -0.76
SDS3P40505 LIP1YMR298W 453 nt10.32□□□□□ -0.76
SDS3P40505 SED1YDR077W 1017 nt10.31□□□□□ -0.76
SDS3P40505 ALP1YNL270C 1722 nt10.3□□□□□ -0.76
SDS3P40505 DBP1YPL119C 1854 nt10.29□□□□□ -0.76
SDS3P40505 YGR012WYGR012W 1182 nt10.28□□□□□ -0.76
SDS3P40505 YLR111WYLR111W 333 nt10.26□□□□□ -0.77
SDS3P40505 YLR279WYLR279W 390 nt10.25□□□□□ -0.77
SDS3P40505 ZRT3YKL175W 1512 nt10.24□□□□□ -0.77
SDS3P40505 SAM1YLR180W 1149 nt10.24□□□□□ -0.77
SDS3P40505 YBL086CYBL086C 1401 nt10.24□□□□□ -0.77
SDS3P40505 MSB4YOL112W 1479 nt10.23□□□□□ -0.77
SDS3P40505 YAT1YAR035W 2064 nt10.22□□□□□ -0.77
SDS3P40505 TOA2YKL058W 369 nt10.22□□□□□ -0.77
SDS3P40505 SHY1YGR112W 1170 nt10.21□□□□□ -0.77
SDS3P40505 HSL7YBR133C 2484 nt10.18□□□□□ -0.78
SDS3P40505 RAD23YEL037C 1197 nt10.18□□□□□ -0.78
SDS3P40505 BRR1YPR057W 1026 nt10.18□□□□□ -0.78
SDS3P40505 HEL2YDR266C 1920 nt10.17□□□□□ -0.78
SDS3P40505 GID7YCL039W 2238 nt10.17□□□□□ -0.78
SDS3P40505 YPL251WYPL251W 303 nt10.17□□□□□ -0.78
SDS3P40505 MET2YNL277W 1461 nt10.16□□□□□ -0.78
SDS3P40505 YMR103CYMR103C 363 nt10.15□□□□□ -0.78
SDS3P40505 MEP3YPR138C 1470 nt10.15□□□□□ -0.78
SDS3P40505 YJL067WYJL067W 351 nt10.14□□□□□ -0.79
SDS3P40505 YMR226CYMR226C 804 nt10.14□□□□□ -0.79
SDS3P40505 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.14□□□□□ -0.79
SDS3P40505 GND2YGR256W 1479 nt10.13□□□□□ -0.79
SDS3P40505 INA1YLR413W 2028 nt10.12□□□□□ -0.79
SDS3P40505 LEU9YOR108W 1815 nt10.12□□□□□ -0.79
SDS3P40505 CAB5YDR196C 726 nt10.1□□□□□ -0.79
SDS3P40505 UGA4YDL210W 1716 nt10.1□□□□□ -0.79
SDS3P40505 SFP1YLR403W 2052 nt10.1□□□□□ -0.79
SDS3P40505 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.09□□□□□ -0.79
SDS3P40505 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.09□□□□□ -0.79
SDS3P40505 CMP2YML057W 1815 nt10.07□□□□□ -0.8
SDS3P40505 NPP1YCR026C 2229 nt10.07□□□□□ -0.8
SDS3P40505 RIB3YDR487C 627 nt10.07□□□□□ -0.8
SDS3P40505 SAM2YDR502C 1155 nt10.07□□□□□ -0.8
SDS3P40505 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.07□□□□□ -0.8
SDS3P40505 URA6YKL024C 615 nt10.07□□□□□ -0.8
SDS3P40505 UFO1YML088W 2007 nt10.07□□□□□ -0.8
SDS3P40505 FRE6YLL051C 2139 nt10.06□□□□□ -0.8
SDS3P40505 OYE3YPL171C 1203 nt10.06□□□□□ -0.8
SDS3P40505 RPC82YPR190C 1965 nt10.04□□□□□ -0.8
SDS3P40505 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.03□□□□□ -0.8
SDS3P40505 CWC15YDR163W 528 nt10.02□□□□□ -0.81
SDS3P40505 PET8YNL003C 855 nt10.02□□□□□ -0.81
SDS3P40505 LOT5YKL183W 921 nt10.01□□□□□ -0.81
SDS3P40505 SMM1YNR015W 1155 nt10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.7 ms