Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPGP40121 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPGP40121 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPGP40121 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPGP40121 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPGP40121 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPGP40121 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPGP40121 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPGP40121 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPGP40121 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPGP40121 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPGP40121 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPGP40121 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPGP40121 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPGP40121 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPGP40121 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPGP40121 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPGP40121 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPGP40121 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPGP40121 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPGP40121 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPGP40121 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPGP40121 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPGP40121 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPGP40121 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPGP40121 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPGP40121 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPGP40121 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPGP40121 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPGP40121 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPGP40121 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPGP40121 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPGP40121 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPGP40121 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPGP40121 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPGP40121 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPGP40121 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPGP40121 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPGP40121 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPGP40121 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPGP40121 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPGP40121 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPGP40121 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPGP40121 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPGP40121 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPGP40121 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPGP40121 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPGP40121 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPGP40121 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPGP40121 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPGP40121 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPGP40121 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPGP40121 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPGP40121 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPGP40121 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPGP40121 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPGP40121 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPGP40121 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPGP40121 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPGP40121 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPGP40121 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPGP40121 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPGP40121 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPGP40121 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPGP40121 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPGP40121 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPGP40121 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPGP40121 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPGP40121 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPGP40121 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPGP40121 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPGP40121 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPGP40121 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPGP40121 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPGP40121 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPGP40121 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPGP40121 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPGP40121 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPGP40121 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPGP40121 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPGP40121 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPGP40121 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPGP40121 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPGP40121 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPGP40121 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPGP40121 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPGP40121 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPGP40121 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPGP40121 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPGP40121 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPGP40121 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPGP40121 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPGP40121 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPGP40121 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPGP40121 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPGP40121 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPGP40121 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPGP40121 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPGP40121 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPGP40121 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 708.8 ms