Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppm1bP36993 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppm1bP36993 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppm1bP36993 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppm1bP36993 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppm1bP36993 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppm1bP36993 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppm1bP36993 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppm1bP36993 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppm1bP36993 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppm1bP36993 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppm1bP36993 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppm1bP36993 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppm1bP36993 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppm1bP36993 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppm1bP36993 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppm1bP36993 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppm1bP36993 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppm1bP36993 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppm1bP36993 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppm1bP36993 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppm1bP36993 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppm1bP36993 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppm1bP36993 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppm1bP36993 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppm1bP36993 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppm1bP36993 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppm1bP36993 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppm1bP36993 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppm1bP36993 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppm1bP36993 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppm1bP36993 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppm1bP36993 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppm1bP36993 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppm1bP36993 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppm1bP36993 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppm1bP36993 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppm1bP36993 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppm1bP36993 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppm1bP36993 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppm1bP36993 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppm1bP36993 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppm1bP36993 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppm1bP36993 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppm1bP36993 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppm1bP36993 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppm1bP36993 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppm1bP36993 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppm1bP36993 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppm1bP36993 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppm1bP36993 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppm1bP36993 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppm1bP36993 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppm1bP36993 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppm1bP36993 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppm1bP36993 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppm1bP36993 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppm1bP36993 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms