Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL3P36405 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARL3P36405 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARL3P36405 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL3P36405 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL3P36405 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARL3P36405 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL3P36405 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARL3P36405 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL3P36405 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL3P36405 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL3P36405 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL3P36405 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL3P36405 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARL3P36405 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL3P36405 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL3P36405 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARL3P36405 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL3P36405 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARL3P36405 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ARL3P36405 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL3P36405 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARL3P36405 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL3P36405 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL3P36405 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL3P36405 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL3P36405 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARL3P36405 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARL3P36405 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL3P36405 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL3P36405 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL3P36405 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARL3P36405 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL3P36405 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARL3P36405 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL3P36405 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL3P36405 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARL3P36405 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARL3P36405 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARL3P36405 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARL3P36405 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL3P36405 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL3P36405 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL3P36405 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARL3P36405 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL3P36405 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARL3P36405 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL3P36405 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARL3P36405 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARL3P36405 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARL3P36405 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL3P36405 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL3P36405 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARL3P36405 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARL3P36405 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARL3P36405 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARL3P36405 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARL3P36405 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARL3P36405 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARL3P36405 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARL3P36405 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARL3P36405 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARL3P36405 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARL3P36405 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ARL3P36405 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARL3P36405 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARL3P36405 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL3P36405 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL3P36405 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL3P36405 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL3P36405 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL3P36405 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL3P36405 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL3P36405 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL3P36405 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL3P36405 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARL3P36405 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARL3P36405 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARL3P36405 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARL3P36405 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL3P36405 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL3P36405 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL3P36405 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARL3P36405 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL3P36405 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARL3P36405 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL3P36405 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL3P36405 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARL3P36405 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARL3P36405 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL3P36405 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL3P36405 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL3P36405 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARL3P36405 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL3P36405 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ARL3P36405 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL3P36405 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL3P36405 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL3P36405 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARL3P36405 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms