Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab21P35282 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab21P35282 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab21P35282 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab21P35282 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab21P35282 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab21P35282 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab21P35282 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab21P35282 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab21P35282 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab21P35282 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab21P35282 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab21P35282 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab21P35282 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab21P35282 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab21P35282 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab21P35282 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab21P35282 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab21P35282 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab21P35282 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab21P35282 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab21P35282 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab21P35282 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab21P35282 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab21P35282 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab21P35282 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab21P35282 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab21P35282 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab21P35282 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab21P35282 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab21P35282 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab21P35282 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab21P35282 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab21P35282 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab21P35282 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab21P35282 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab21P35282 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab21P35282 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab21P35282 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab21P35282 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab21P35282 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab21P35282 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab21P35282 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab21P35282 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rab21P35282 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rab21P35282 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab21P35282 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab21P35282 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab21P35282 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab21P35282 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab21P35282 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab21P35282 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab21P35282 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab21P35282 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab21P35282 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab21P35282 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab21P35282 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab21P35282 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab21P35282 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rab21P35282 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab21P35282 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab21P35282 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab21P35282 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab21P35282 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab21P35282 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab21P35282 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab21P35282 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab21P35282 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab21P35282 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab21P35282 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab21P35282 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab21P35282 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab21P35282 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab21P35282 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab21P35282 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms