Protein–RNA interactions for Protein: P35030

PRSS3, Trypsin-3, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS3P35030 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRSS3P35030 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRSS3P35030 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRSS3P35030 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRSS3P35030 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRSS3P35030 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRSS3P35030 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRSS3P35030 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRSS3P35030 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRSS3P35030 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRSS3P35030 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRSS3P35030 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRSS3P35030 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRSS3P35030 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRSS3P35030 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRSS3P35030 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRSS3P35030 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRSS3P35030 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRSS3P35030 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRSS3P35030 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRSS3P35030 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRSS3P35030 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRSS3P35030 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRSS3P35030 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRSS3P35030 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS3P35030 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS3P35030 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRSS3P35030 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRSS3P35030 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRSS3P35030 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRSS3P35030 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRSS3P35030 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS3P35030 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS3P35030 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS3P35030 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRSS3P35030 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRSS3P35030 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRSS3P35030 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRSS3P35030 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRSS3P35030 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRSS3P35030 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms