Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXN2P32314 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXN2P32314 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXN2P32314 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXN2P32314 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXN2P32314 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXN2P32314 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXN2P32314 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXN2P32314 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXN2P32314 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FOXN2P32314 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FOXN2P32314 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXN2P32314 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXN2P32314 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXN2P32314 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FOXN2P32314 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXN2P32314 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FOXN2P32314 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXN2P32314 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXN2P32314 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXN2P32314 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXN2P32314 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXN2P32314 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXN2P32314 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXN2P32314 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXN2P32314 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXN2P32314 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXN2P32314 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXN2P32314 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXN2P32314 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXN2P32314 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FOXN2P32314 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXN2P32314 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXN2P32314 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXN2P32314 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXN2P32314 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXN2P32314 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXN2P32314 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXN2P32314 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXN2P32314 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXN2P32314 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXN2P32314 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXN2P32314 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXN2P32314 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXN2P32314 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXN2P32314 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXN2P32314 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXN2P32314 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXN2P32314 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXN2P32314 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXN2P32314 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXN2P32314 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXN2P32314 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXN2P32314 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms