Protein–RNA interactions for Protein: P32189

GK, Glycerol kinase, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKP32189 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GKP32189 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GKP32189 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GKP32189 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GKP32189 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GKP32189 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GKP32189 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GKP32189 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GKP32189 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GKP32189 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GKP32189 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GKP32189 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GKP32189 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GKP32189 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GKP32189 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GKP32189 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GKP32189 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GKP32189 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GKP32189 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GKP32189 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GKP32189 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GKP32189 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GKP32189 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GKP32189 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GKP32189 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GKP32189 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GKP32189 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GKP32189 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GKP32189 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GKP32189 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GKP32189 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GKP32189 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GKP32189 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GKP32189 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GKP32189 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GKP32189 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GKP32189 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GKP32189 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GKP32189 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GKP32189 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GKP32189 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GKP32189 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GKP32189 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GKP32189 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GKP32189 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GKP32189 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GKP32189 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GKP32189 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GKP32189 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GKP32189 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GKP32189 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GKP32189 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GKP32189 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GKP32189 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GKP32189 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GKP32189 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GKP32189 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GKP32189 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GKP32189 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GKP32189 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GKP32189 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GKP32189 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GKP32189 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GKP32189 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GKP32189 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GKP32189 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GKP32189 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GKP32189 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GKP32189 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GKP32189 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GKP32189 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GKP32189 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GKP32189 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GKP32189 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GKP32189 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GKP32189 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GKP32189 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GKP32189 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GKP32189 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GKP32189 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GKP32189 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GKP32189 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GKP32189 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GKP32189 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GKP32189 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKP32189 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKP32189 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKP32189 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GKP32189 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GKP32189 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GKP32189 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GKP32189 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GKP32189 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GKP32189 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GKP32189 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GKP32189 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GKP32189 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GKP32189 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GKP32189 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GKP32189 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms